Afera JBTZ se je začela 31. maja 1988, ko sta slovenska služba državne varnosti in vojaška varnostna služba zaradi suma izdaje vojaške skrivnosti sinhronizirano aretirali Janeza Janšo, tedanjega komentatorja Mladine, in Ivana Borštnerja, tedanjega zastavnika JLA. Štiri dni pozneje je bil aretiran in pridržan tudi takratni notranjepolitični urednik Mladine David Tasič, medtem ko oblastem ni uspelo aretirati četrtega obtoženega, tedanjega odgovornega urednika Mladine, Francija Zavrla.
Osemnajstega julija 1988 se je zaradi domnevne izdaje vojaške skrivnosti začel sodni proces proti četverici, ki je potekal za zaprtimi vrati vojaškega sodišča v Ljubljani, v času procesa pa so se državljani množično zbirali pred vojaškim sodiščem. Že 31. maja je bil namreč ustanovljen Odbor za varstvo pravic Janeza Janše (pozneje Odbor za varstvo človekovih pravic), ki je pod vodstvom Igorja Bavčarja med drugim organiziral protestno zborovanje na Kongresnem trgu v Ljubljani, ki se ga je udeležilo več kot 30.000 ljudi.
