Zlorabe položaja in pravic naj bi bila osumljena nekdanji predsednik uprave Luke Robert Časar in nekdanji član uprave Pavle Krumenaker, ki naj bi z eno od služb za varovanje sklenila in izvajala pogodbo o poslovnem sodelovanju na področju varovanja in zaščite, čeprav je imela Luka za to dejavnost organizirano svojo službo. Služba za varovanje, ki za izvajanje storitev varovanja ni bila registrirana in ni imela ustrezne licence, si je z izstavitvijo najmanj 24 računov za fiktivne storitve pridobila premoženjsko korist v višini 76.500 evrov, medtem ko je Luka Koper utrpela škodo v enaki višini.
Nekdanji predsednik uprave naj bi poleg tega odredil plačilo najmanj 30 prejetih računov čiščenja zasebnih oblačil enega od zaposlenih v isti družbi, ki so bili knjiženi kot stroški čiščenja službenih oblačil, s čimer je Luki povzročil za skoraj 4000 evrov škode. Kriminalisti pa so ovadili tudi vodjo enega od centrov v isti družbi, menda gre za vodjo evropskega energetskega terminala Barbaro Humar Trebec, ki ji očitajo kaznivo dejanje poneverbe, šest kaznivih dejanj ponarejanja listin in šest kaznivih dejanj ponareditve ali uničenja poslovnih listin. Do protipravne premoženjske koristi v višini več kot 7500 evrov naj bi se dokopala s kupovanjem dragih oblačil zase in za druge, ki jih je knjižila kot nakupe "delovnih oblačil", prevzemala pa jih je z izstavljanjem dobavnic.
