Glede na to, da ŠOUP vodi Sebastjan Kokl, ki je hkrati tudi predsednik koprske SD, rektor Bohinc pa je ravno tako član vladajoče SD, so se že pojavila namigovanja, da je reakcija ŠOUP politično motivirana in da stranka SD na tak način rešuje svojega strankarskega kolega, kar pa so v ŠOUP zanikali. "ŠOUP podpira prizadevanja študentskega sveta UP, da zaščiti zakonitost in ugled UP, pri tem pa ugotavljamo, da je še nekaj manevrskega prostora in da je smiselno nastalo agonijo najprej reševati "od spodaj navzgor". Za nastalo situacijo je krivo predvsem vodstvo Fakultete za management in ne rektor, ki je nepravilnosti začel odkrivati takoj po svojem prihodu. Res pa je, da nekateri postopki še trajajo, zato je treba preprečiti škodo, ki se dela za vso UP. Rektor ne more neposredno odgovarjati za stvari, ki so se dogajale že pred njegovim prihodom, mora pa poskrbeti, da odgovorni prevzamejo svojo odgovornost, pojasnjujejo v ŠOUP in dodajajo, da s svojimi prizadevanji ščitijo izključno interese študentov, saj nastala situacija meče slabo luč na vse študente UP. "Pri tem ni prostora za politično vpletanje, ampak izključno za zaščito interesov študentov UP," so še pojasnili.
Pomisleki o politizaciji ŠOUP so se pojavili takoj, ko je bil Sebastjan Kokl pred meseci izvoljen za predsednika koprske SD, zato so nekateri menili, da bi bilo dobro, da bi Kokl odstopil kot direktor ŠOUP. Vendar je Kokl takrat pojasnil, da tega ne bo storil, ker je "delo v stranki prostovoljno in neprofesionalno". Dodal je, da mora tako kot vsi predsedniki stranke delati še kaj drugega za svoje preživetje in kariero ter da pravih očitkov glede tega še ni slišal. "So le tisti očitki, ki so izzvani s strani tistih, ki bi radi obremenili moje delo z natolcevanjem in zavajanjem. Sam prej vidim problem v tem, da je pri nas žal še vedno stigmatizirano politično delovanje. A to je čuden pristop, saj je ravno politika tista, ki najbolj opredeljuje naš način življenja in razvoja."
