Giannakopoulos je skupaj s pokojnim bratom Pavlosom grškega velikana prevzel leta 1987, med letoma 2002 in 2012 pa je bil tudi predsednik kluba. V njunem času so Atenčani kar šestkrat postali evropski klubski prvaki, in sicer v letih 1996, 2000, 2002, 2007, 2009 in 2011.

Pod pet od omenjenih šestih lovorik se je podpisal odlični srbski strokovnjak Željko Obradović, ki je Panathinaikos vodil med letoma 1999 in 2012. »S Thanasisom sem v Atenah preživel kar trinajst let. Bil je izjemen človek, ki mi je pomagal na prav vsakem koraku. Pa ne samo meni. Zelo ga bom pogrešal,« je povedal Željko Obradović.

Evroliga, 27. krog: Anadolu Efes – CSKA 78:80, Fenerbahče – Budućnost 76:67, Olympiacos – Bayern 89:69, Barcelona – Gran Canaria 93:64, Darušafaka – Himki 91:85, Panathinaikos – Baskonia 72:70, Maccabi – Žalgiris 83:85, 28. krog, danes ob 18. uri: CSKA – Fenerbahče, ob 20. uri: Budućnost – Anadolu Efes, Bayern – Barcelona, ob 21.30: Gran Canaria – Olympiacos, jutri ob 18. uri: Himki – Maccabi, ob 19. uri: Žalgiris – Darušafaka, ob 20.30: Baskonia – Real Madrid, ob 20.45: Milano – Panathinaikos. gte