Zgodba s pripojitvijo Stavbenika Primorju se je odvijala leta 2001, preiskava spornih poslov pa je potekala od leta 2006. Medtem ko je Črnigoj ob odhodu s sodišča zgolj vljudno pozdravil novinarje in pospešil korak, je njegov odvetnik Janez Koščak pojasnil, da tožilstvo svojo zgodbo gradi na odločbi davčne uprave iz leta 2004, ki pa je bila štiri leta kasneje razveljavljena, in sklenil, da pri pripojitvi Stavbenika ni bilo nič narobe. Drugače menijo v Primorju. Po njihovih podatkih naj bi Černigoj na podlagi vnaprejšnjega dogovora z direktorjem družbe Vital slednji prodal več kot 95.000 delnic Stavbenika po ceni 1825 tedanjih tolarjev, vedoč, da je to za 3523 tolarjev nižja cena od ugotovljene menjalne vrednosti. Po besedah Koščaka obtožba namiguje tudi na vprašanje, s čigavimi sredstvi je nato Črnigoj delnice kupil, zato zahteva predložitev plačilnih list, iz katerih naj bi bilo razvidno, da so Črnigoju in preostalim kupcem vsak mesec za ta namen trgali 10 odstotkov plače in da so do delnic tako prišli z lastnimi dohodki.

Tožilstvo je v nadaljevanju postopka predlagalo zaslišanje skorajda 30 prič, med njimi direktorja družbe Vital Bojana Kende, Črnigojevi zagovorniki pa tudi nekdanjega finančnega direktorja Alojza Bolčino in Jožeta Vrabca, ki je vodil projekt pripojitve Stavbenika Primorju. Predlagajo pa tudi pridobitev zajetnega kupa listin o pripojitvi. Mikulinova je včeraj temu oporekala in meni, naj obtoženi dokaze pridobi sam, saj je Primorje v stečaju in ni potrebno, da bi mu povzročali dodatne stroške.