"Ocenjujem, da bi razkritje tajnih podatkov v arhivskem gradivu, ki je bilo prevzeto na podlagi prevzemnega zapisnika med Arhivom RS in Slovensko obveščevalno-varnostno agencijo (Sova), nepoklicani osebi lahko hudo škodovalo varnosti in interesom Republike Slovenije, zato v skladu z zakonom o tajnih podatkih navedenemu gradivu določa stopnjo tajnosti," je piše v dokumentu, ki ga je Rupnik izdal 1. julija 2008.

Oznako zaupno je na dokumente nekdanje SDV, katerih vpogled je zahteval publicist Igor Omerza, dal tudi trenutni direktor Sove Sebastjan Selan, na kar pa se je opozicija, predvsem stranka SDS kritično odzvala. Zaradi tega je parlamentarna komisija za nadzor obveščevalnih in varnostnih služb, katere predsednik je poslanec SDS Zvonko Černač, sklenila Selana kazensko ovaditi in predlagala njegovo krivdno razrešitev.

Nekateri koalicijski poslanci so opozarjali, da je tudi prejšnja vlada z uredbo omogočala tajnost arhivov nekdanje SDV. V SDS so na to zapisali, da je bila omenjena uredba vlade iz leta 2007 sprejeta z namenom odprave nezakonitega zadrževanja arhivov na Sovi, ni pa v ničemer spreminjala tajnosti in dostopnosti dokumentom.

Državni zbor pa je pred tednom potrdil novelo zakona o varstvu dokumentarnega in arhivskega gradiva ter arhivih, ki ga je vlada vložila v parlamentarno proceduro po nujnem postopku. Sprememba uvaja komisijo, ki bo presojala dostopnost do gradiv nekdanje SDV.