Iz zapora so ga odpeljali v bolnišnico, kjer so podali oceno o njegovi zmožnosti za služenje vojaškega roka, saj tega še ni opravil. Zdravniki so po temeljitem pregledu ocenili, da Agca za služenja vojaškega roka ni sposoben. Podobno oceno so sicer podali že leta 2006, ko so kot glavni razlog za tako mnenje navedli "hude asocialne osebnostne motnje", poroča ameriška tiskovna agencija AP.
Agca se je po pregledu v spremstvu varnostnikov napotil v enega izmed hotelov v Ankari, kjer naj bi preživel prihodnjih nekaj dni. Sicer pa tuje tiskovne agencije poročajo, da je ob odhodu iz zapora njegov odvetnik objavil izjavo, v kateri se je Agca razglasil za "večnega Kristusa, ki bo napisal nov evangelij, saj je obstoječi prepoln zmot". Obenem je tudi napovedal, da bo človeštvo še v tem stoletju doletela apokalipsa in s tem izumrtje človeštva.
Tedaj 23-letni Agca je 13. maja 1981 na Trgu svetega Petra v Vatikanu med avdienco streljal na tedanjega papeža in ga hudo ranil v trebuh. Sprva je trdil, da je bil napad na papeža del božjega načrta, na zaslišanju pred sodiščem pa je večkrat spremenil svojo zgodbo. Trditev, da naj bi za napadom stali Sovjetska zveza ali Bolgarija, sicer niso nikoli dokazali.
Agca je 19 let preživel v italijanskem zaporu, od koder so ga izpustili leta 2000 ter ga izgnali v Turčijo. Tam je bil obsojen zaradi umora novinarja Abdija Ipekcija, dveh oboroženih ropov in pobega iz zapora. Vsa omenjena dejanja je storil v 70. letih prejšnjega stoletja.
Janez Pavel II. se je dve leti po atentatu v italijanskem zaporu sestal z Agco in mu odpustil napad.
