Goncalo Amaral je kot eden najbolj izkušenih portugalskih detektivov maja 2007 prevzel primer triletne Madeleine McCann, ki je izginila iz apartmaja v kraju Praia da Luz. Zaradi njegove teorije, da je deklica ponesreči umrla in sta njena starša Kate in Gerry McCann to prikrila ter skrila njeno truplo, sta starša postala osumljenca v primeru. Zaradi kontroverznosti njegovega preiskovanja so ga po nekaj mesecih odstranili s primera, Amaral pa se je predčasno upokojil.
McCannova sta kasneje dokazala, da nista sodelovala pri izginotju hčere, Amaral pa je svoje obtožbe ponovil v svoji knjigi. Ta je sedaj postala predmet tožbe McCannovih proti Amaralu zaradi klevetanja in žaljenja.
Amaral pa je bil sedaj spoznan za krivega ponarejanja dokazov, da bi pomagal prikriti obtožbe proti trem svojim policistom, obtoženih mučenja. Sojenje je potekalo glede preiskovanja primera osemletne Joane Cipriano, ki je v bližini Praie de Luz izginila leta 2004. Njena mati Leonor in stric Joao Cipriano sta bila spoznana za kriva njenega umora, čeprav trupla deklice niso nikoli našli. Dvojica je kasneje trdila, da so policisti priznanje iz njiju dobili z mučenjem, policija pa trdi, da je Leonora skušala storiti samomor, ko se je vrgla po stopnicah. Trije inšpektorji, Leonel Marques, Pereira Cristovao in Paulo Marques Bom, so bili na sodišču oproščeni obtožnic mučenja, porota pa je Amarala kljub temu spoznala za krivega ponarejanja dokazov, s katerimi je skušal pomagati svojim kolegom. Za krivega ponarejanja dokazov je bil spoznan tudi peti policist, Antonio Nunes Cardoso, ki je bil obsojen na dve leti in pol pogojne zaporne kazni.
Amaral je po sodbi dejal, da ni presenečen nad izidom, meni pa, da je zato kriv "politični pritisk“. Namignil je, da se bo na razsodbo pritožil. McCannova nista želela podati komentarja.
