Največ prilagoditev bo potrebnih na progah v smeri Gorenjske in Primorske. Vlaki, namenjeni proti Divači, Sežani in Kopru, bodo v tem časovnem obdobju odpeljali z začasnega perona ob Dunajski cesti, označenega s tirom 94. Prvi jutranji vlak RG 1605 bo ob 6. uri sicer še odpeljal z osrednjega dela postaje, vsi naslednji do 17.30 pa bodo preusmerjeni. Za posamezne povezave na relaciji med Ljubljano in Borovnico oziroma Brezovico bo organiziran tudi nadomestni avtobusni prevoz. Podobno velja za potnike proti Kranju in Jesenicam, saj bo tudi na tej progi za nekatere vlake prevoz opravljen z avtobusi.
Potniki, ki potujejo proti Zidanemu Mostu, Celju, Mariboru ali Dobovi, bodo morali do svojih vlakov dostopati na začasnih peronih ob križišču Masarykove ceste in Njegoševe ulice (tiri 95, 96, 97 in 98). Ta ureditev bo veljala za vlake, ki vozijo znotraj napovedane časovne zapore. Poleg tega bo za določene vlake med postajama Ljubljana in Ljubljana Zalog vožnjo opravil nadomestni avtobus. Za potnike na dolenjski progi, v smeri Grosuplja, Novega mesta ali Kočevja, tokrat posebnih sprememb ne bo, saj njihovi vlaki že dlje časa redno uporabljajo omenjene perone na Masarykovi cesti.
Posebna logistika je predvidena za potnike v tranzitnem in mednarodnem prometu. Potniki, ki se bodo v prestolnico pripeljali z vlakom IC 503 iz smeri Hodoša in potovanje nadaljujejo proti Kopru, bodo na območju postaje prestopili na poseben avtobusni transfer. Ta jih bo odpeljal s peronov na Masarykovi cesti do postaje Ljubljana Dolgi most, kjer se bodo ponovno priključili na vlak IC 503. Tisti, ki z istim vlakom pot začnejo v Ljubljani, bodo vstopili na peronu tir 94 ob Dunajski cesti. Zaradi del na progi bo po prilagojenem voznem redu in z nadomestnim prevozom potekal tudi promet mednarodnih vlakov EC 210 in EC 211 proti Reki.
Na Slovenskih železnicah potnike opozarjajo, da je za dostop od glavne postajne stavbe na Trgu Osvobodilne fronte do obeh lokacij z začasnimi peroni potrebnih vsaj deset minut hoje, saj je razdalja okoli 600 metrov. Vsa postajališča nadomestnih avtobusov so zbrana na ploščadi ob tiru 1. Ker na začasnih peronih ni kartomatov, je priporočljivo, da si potniki vozovnico zagotovijo pred prihodom na postajo. Natančne informacije o voznih redih in lokacijah so na voljo na spletni strani SŽ, za pomoč pa je med 6. in 22. uro na voljo tudi brezplačna telefonska številka 080 81 11. Potnikom svetujejo, da se na pot odpravijo prej kot običajno.