Predlog je slaba nadgradnja že zdaj nepreglednega pravilnika, menijo. Pričakovali so, da bo Javna agencija za raziskovalno dejavnost Republike Slovenije pri pripravi predloga akta na pregleden način uveljavila določbe novega zakona za znanstvenoraziskovalno in inovacijsko dejavnost ter dosledno upoštevala strateške dokumente Slovenije in dognanja stroke. Menijo, da so pravila v aktu nedoločena oziroma zasnovana tako, da omogočajo arbitrarno izbiro na razpisih, saj odločilne vloge pri izboru projektov nima ocena projekta, pridobljena z mednarodno evalvacijo.