Razkritje primera Fuentes, ki so ga španski mediji poimenovali Operacion Puerto, je leta 2006 dodobra pretresla kolesarstvo, saj je bilo več kot 50 poklicnih kolesarjev takrat osumljenih zlorabe prepovedanih poživil. Med pričami so je znašlo deset kolesarjev, toda le trije - Španec Jesus Manzano, Američan Tyler Hamilton in Nemec Jörg Jaksche - so spregovorili o izkušnjah s Fuentesom. Policija je med preiskavami maja 2006 odkrila več kot 200 vrečk s krvjo. Istega leta je namreč v Španiji doping postal nezakonit.

Sodišče se je odločilo za milejšo kazen od predlagane. Tožilci so namreč zahtevali vsaj dveinpolletno zaporno kazen kot ukrep za očiščenje slabega ugleda španskega športa, čeprav Fuentes ni bil obtožen dopinških kršitev. Hkrati so mu za štiri leta prepovedali opravljanje zdravniškega poklica.

Sodišče je za krivega spoznalo tudi kolesarskega funkcionarja Joseja Ignacia Labarto, ki so mu izrekli štirimesečno zaporno kazen, preostale tri obtožence pa je oprostilo.