Karl je dejal, da ga ponovno čaka zdravljenje z obsevanjem in kemoterapijo ter da bo verjetno moral zato izpuščati tekme in treninge.

Vodstvo Denverja se je 12. februarja s Karlom dogovorilo za podaljšanje pogodbe do konca sezone 2010-2011. Karl je drugi najuspešnejši trener v zgodovini Denverja (260 zmag) in je ekipo v zadnjih petih sezonah vedno pripeljal v končnico, v klubu pa je od januarja leta 2005.

Karl je košarkarje Nuggets v tej sezoni vodil do rekordnih 35 zmag in 18 porazov, obenem pa je bil trener ekipe Zahoda na nedeljski tekmi vseh zvezd lige v Dallasu. V lanski končnici je Denver v finalu zahodnega dela lige izgubil proti poznejšim prvakom, igralcem Los Angeles Lakers.