Mlakar je beli dres Hajduka nosil dvakrat v dosedanji karieri. Po dveh sezonah, v katerih je sodeloval tudi pri osvojitvi dveh pokalov (2021, 2023), je tokrat prišel v Dalmacijo v zimskem prestopnem roku.
Toda zaradi poškodb je v Hajdukovem dresu zbral zgolj šest nastopov in dosegel en gol. Letošnjo nogometno sezono je končal že aprila. Skupno je slovenski napadalec v svoji karieri za Hajduk odigral 87 tekem in dosegel 22 golov.
Pisa bo v novi sezoni nastopala v prvoligaški druščini Serie A. Toda vprašanje je, ali bo Jan Mlakar za italijanski klub tudi igral.
